Голова Українського інституту національної пам'яті Антон Алфьоров висловився щодо діяльності музею Михайла Булгакова. Він наголосив, що музеї мають виконувати передусім виховну функцію, і поставив під сумнів відповідність цього закладу таким завданням.
За словами Алфьорова, носії російської ідентичності не сприймають українську державність, оскільки вважають її ворожою. Саме до цієї категорії, на думку посадовця, належав письменник Михайло Булгаков.
Таким чином, було поставлено питання про доцільність існування музею, присвяченого постаті, чиї ідеологічні погляди суперечать цінностям сучасної української держави.